* Cinq de ses ennemis (Norman Osborn et Harry Osborn, le Caméléon, le Chacal, Venom) s'en serviront contre lui, au point de mettre sa famille en danger et de le faire douter de son identité.
* Le docteur Octopus lui aussi connaîtra l'identité de Parker, mais par égard pour sa tante cherchera plutôt à lui venir en aide. Quand à Kraven, son code de l'honneur l'empêchera d'utiliser l'identité de son ennemi contre lui.
* Mary-Jane est au courant depuis la première apparition de Spider-Man, mais elle mettra très longtemps à le lui dire, et plus à l'accepter.
* Sa tante découvre son secret suite à son premier affrontement avec Morlun (elle trouve le costume en lambeaux dans son appartement). Elle mettra du temps à accepter la vie dangereuse de son neveu mais finira par l'épauler du mieux possible.
* Dans ses alliés occasionnels, Daredevil le rencontrera plusieurs fois, mais ils évolueront toujours dans deux vies différentes, jusqu'à ce que Mysterio, ennemi de Spider-Man, s'acharne à détruire la vie de Daredevil.
* Robbie Robertson et George Stacy sont sans aucun doute persuadés de la double identité de Peter Parker/Spider-Man, mais ils n'en auront jamais la moindre preuve, et le traiteront toujours comme un héros.
* Le reporter Ben Urich (par ailleurs ami de Daredevil) a déduit la double identité de son collègue lors de la révélation de l'identité secrète de Matt Murdock dans les pages du Daily Globe, mais ne le lui avouera que pour les besoins d'une enquête.
* De même, ses collègues les New Avengers sont tous au courant de son identité secrète.
Dans l'une des sagas les plus longues et controversées de l'histoire des comics, la Saga des Clones, la vie de Spider-Man fut bouleversée par l'irruption de ses clones, Ben Reilly et Kaine. Il crut même un moment être le clone et abandonna le costume de Spider-Man à Reilly. Finalement, Peter Parker récupéra le costume à la mort de Reilly, qui se révéla bien être un clone.
Avant Civil War, Peter Parker habitait avec sa femme Mary Jane et sa tante (après les incendies criminels qui ont ravagé son appartement et la maison de tante May) dans la Tour Stark, qui était aussi le QG des New Avengers, dont Spider-Man faisait partie (avec Captain America, Wolverine, Spider-Woman, Iron Man, Luke Cage et Sentry).
Durant Civil War, la vie de Spider-Man a changé à jamais car Peter a révélé son identité secrète au monde